Nació en Rosario, el 29 de octubre de 1908. Fue miembro del primer consejo Diocesano de la J.A.C. desde su fundación en 1934, y presidente el primer Centro Universitario de Acción Católica, siendo estudiante de medicina.

Al terminar los estudios y ejercer su profesión durante un año, ingreso en el seminario de Villa Devoto de Buenos Aires, el 14 de enero de 1935 -a los 28 años- adonde lo envió Mons. Antonio Caggiano.

Fue ordenado sacerdote el 19 de diciembre de 1942.

Fue nombrado Profesor del Seminario Diocesano de Rosario. En 1947 se lo designó director espiritual del Seminario Diocesano, cargo que ocupó hasta su elevación al episcopado.

Pío XII, lo nombró Camarero Secreto Supernumerario, en el año 1954; y el 22 de mayo de 1956 el Papa lo preconizó Obispo titular de Chersoneso de Europa, y lo designo Auxiliar del Cardenal Caggiano.

El 24 de agosto siguiente fiesta de San Bartolomé Apóstol, recibe la Consagración Episcopal, junto a Mons. Francisco J. Vennera, Obispo titular de Abittine, y también, Auxiliar de Rosario. Es consagrante el Cardenal, y su co-consagrante el Obispo de Santa Fe, Mons. Manuel Marengo.

Vacante la Sede de Rosario, por el traslado del Cardenal Caggiano al Arzobispado de Buenos Aires, el Cabildo Diocesano lo eligió Vicario Capitular en octubre de 1959; ejerciendo hasta diciembre del mismo año, en que asumió la diócesis el 2º Obispo Mons. Silvino Martínez.

Tras fallecer Mons. Martínez, es elegido Vicario Capitular y el 11 de julio de 1969 Juan XXIII lo traslada a San Luis.

Mons. Carlos María Cafferata, falleció en Rosario el 6 de julio de 1971, y sus restos descansan en la catedral de San Luis, en el Altar del Calvario.